在网络时代，侵权行为屡禁不止，给网站运营者带来了诸多困扰。针对网站侵权问题，运营者应该采取有效措施来处理，保护自身权益和用户利益。

首先，网站运营者应建立完善的版权保护体系。建立版权声明页面，并在网站上明确标注原创内容，加强对用户上传内容的审核和监控，确保网站内容的合法性和原创性。

其次，及时发现侵权行为并采取有效的应对措施。一旦发现侵权行为，要立即联系侵权方，要求删除侵权内容，或者通过法律手段维护自身权益。同时，可以向相关部门举报侵权行为，加大打击力度。

此外，加强用户教育和意识提升也是防范侵权的重要措施。网站运营者可以定期发布关于版权保护的文章或公告，引导用户自觉遵守版权法律法规，树立版权意识，共同维护网络环境的健康发展。

总之，网站侵权问题是一个长期而且严重的挑战，网站运营者需要高度重视并采取有效措施来处理。只有建立健全的版权保护体系，及时发现并处理侵权行为，加强用户教育和意识提升，才能更好地保护自身权益，维护网络环境的秩序和和谐。